Portfolio WAFE filtrů obsahuje modely s rozdílnou jemností filtrace: M5 a F7 (součást balení) poskytují vysoký standard vzduchové hygieny; F9 je vhodný do oblastí s nadměrným znečištěním vzduchu; a kombinovaný F7/AC s příměsí aktivovaného uhlíku absorbuje pachy a těkavé organické látky (VOC: Volatile Organic Compounds) produkované rostlinami, zvířaty i čisticími prostředky, barvami nebo jinou průmyslovou zátěží.

Filtry je třeba měnit v závislosti na prostředí, ve kterém je jednotka provozována. Běžně 2x za rok, nejméně však 1x za rok. Při nevyměněných filtrech déle jak 1 rok, se jednotka zastaví z důvodu ochrany zařízení při provozu s nečistými filtry.